私が経験した失敗を以下に記します．
これは何が原因でスメアーになっていると思いますか？
この失敗は，アガロースゲルを作る際に，
アガロース粉末を1xTAEに溶解させるところを
ラボメイトが間違えて純水で溶かしたのが原因でした．
純水で溶かした事によってゲルの緩衝能がなくなり，
バンド (PCR産物だけでなくサイズマーカーも) がスメアーになったみたいです．
私が学部4年生の頃の失敗談です．
同じ研究室に同期は6人所属していました．
研究を初めて1,2ヶ月の頃です．
PCR後の電気泳動で
スメアーになる人が続出したため
みんなで3日間かけて検討したところ
原因はアガロースゲルの作り方を
間違えただけでした...OTL